A partir de janeiro de 1936 até janeiro de 1940, o Liceu São Paulo funcionou na Avenida Conselheiro Nébias, nº 184. Após essa data, foi transferido para a Avenida Ana Costa, nº 146, onde permanece até os dias de hoje, situada dentro de uma área de 4.200m² em uma das mais nobres avenidas de nossa cidade, na confluência entre os bairros da Encruzilhada , Vila Mathias e Vila Belmiro. É reconhecida como uma das escolas mais tradicionais de Santos.
Anos depois, a escola passou a ser dirigida pelo Professor Dr. Gil Stockler de Lima, filho do Inspetor Municipal da Educação, Professor Delphino Stockler de Lima.
Em 11 de fevereiro de 1960, assume a Direção do Liceu São Paulo o então Vereador Professor Domingos Fuschini e sua esposa, Professora Odair Guimarães Fuschini. A partir de 1967 ambos passaram a ser os únicos proprietários da Escola e do prédio onde se situa o Liceu São Paulo atualmente, quando , a partir de então, a escola implantou a filosofia da educação integral, isto é, educação do espírito e do corpo, valorizando os aspectos éticos do indivíduo.
A escola abrigava, em média, cerca de mil e seiscentos alunos anualmente, distribuídos em três prédios. Seu curso secundário, voltado para a área comercial, por décadas seguidas, foi um dos mais respeitados e tradicionais da região.
